Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEFMP07197 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEFMP07197 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NEFMP07197 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NEFMP07197 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEFMP07197 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEFMP07197 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEFMP07197 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NEFMP07197 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NEFMP07197 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NEFMP07197 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NEFMP07197 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEFMP07197 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEFMP07197 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEFMP07197 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEFMP07197 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEFMP07197 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEFMP07197 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEFMP07197 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEFMP07197 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEFMP07197 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEFMP07197 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NEFMP07197 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEFMP07197 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEFMP07197 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NEFMP07197 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEFMP07197 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEFMP07197 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEFMP07197 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEFMP07197 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEFMP07197 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEFMP07197 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEFMP07197 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEFMP07197 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEFMP07197 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEFMP07197 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEFMP07197 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEFMP07197 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEFMP07197 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEFMP07197 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NEFMP07197 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEFMP07197 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEFMP07197 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEFMP07197 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEFMP07197 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEFMP07197 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEFMP07197 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEFMP07197 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEFMP07197 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEFMP07197 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEFMP07197 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEFMP07197 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEFMP07197 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEFMP07197 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEFMP07197 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEFMP07197 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEFMP07197 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEFMP07197 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEFMP07197 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEFMP07197 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEFMP07197 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEFMP07197 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEFMP07197 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEFMP07197 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEFMP07197 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEFMP07197 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEFMP07197 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEFMP07197 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEFMP07197 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFMP07197 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFMP07197 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFMP07197 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEFMP07197 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEFMP07197 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEFMP07197 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEFMP07197 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEFMP07197 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEFMP07197 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEFMP07197 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEFMP07197 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEFMP07197 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NEFMP07197 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEFMP07197 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEFMP07197 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFMP07197 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFMP07197 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFMP07197 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFMP07197 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFMP07197 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFMP07197 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEFMP07197 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEFMP07197 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEFMP07197 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEFMP07197 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEFMP07197 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms