Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINA1P01009 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINA1P01009 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA1P01009 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINA1P01009 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINA1P01009 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINA1P01009 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.6 ms