Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4FO95754 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4FO95754 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA4FO95754 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4FO95754 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4FO95754 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4FO95754 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4FO95754 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms