Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FARP2O94887 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FARP2O94887 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FARP2O94887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FARP2O94887 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FARP2O94887 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FARP2O94887 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FARP2O94887 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FARP2O94887 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FARP2O94887 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FARP2O94887 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FARP2O94887 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FARP2O94887 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FARP2O94887 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
FARP2O94887 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FARP2O94887 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FARP2O94887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FARP2O94887 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FARP2O94887 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FARP2O94887 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FARP2O94887 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FARP2O94887 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FARP2O94887 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FARP2O94887 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FARP2O94887 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FARP2O94887 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FARP2O94887 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FARP2O94887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FARP2O94887 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FARP2O94887 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FARP2O94887 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FARP2O94887 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FARP2O94887 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FARP2O94887 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FARP2O94887 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FARP2O94887 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FARP2O94887 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FARP2O94887 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FARP2O94887 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FARP2O94887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FARP2O94887 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FARP2O94887 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FARP2O94887 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FARP2O94887 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FARP2O94887 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FARP2O94887 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FARP2O94887 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FARP2O94887 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FARP2O94887 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FARP2O94887 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FARP2O94887 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FARP2O94887 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FARP2O94887 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FARP2O94887 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FARP2O94887 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FARP2O94887 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FARP2O94887 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
FARP2O94887 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FARP2O94887 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FARP2O94887 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FARP2O94887 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FARP2O94887 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FARP2O94887 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FARP2O94887 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FARP2O94887 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FARP2O94887 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FARP2O94887 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FARP2O94887 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FARP2O94887 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FARP2O94887 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FARP2O94887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FARP2O94887 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FARP2O94887 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FARP2O94887 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FARP2O94887 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FARP2O94887 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FARP2O94887 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FARP2O94887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FARP2O94887 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FARP2O94887 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FARP2O94887 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FARP2O94887 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FARP2O94887 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FARP2O94887 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FARP2O94887 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FARP2O94887 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FARP2O94887 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FARP2O94887 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FARP2O94887 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FARP2O94887 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FARP2O94887 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FARP2O94887 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FARP2O94887 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FARP2O94887 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FARP2O94887 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms