Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEBLO76041 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEBLO76041 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEBLO76041 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEBLO76041 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEBLO76041 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEBLO76041 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEBLO76041 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEBLO76041 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEBLO76041 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEBLO76041 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEBLO76041 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEBLO76041 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEBLO76041 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEBLO76041 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEBLO76041 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEBLO76041 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEBLO76041 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEBLO76041 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEBLO76041 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEBLO76041 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEBLO76041 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEBLO76041 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEBLO76041 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEBLO76041 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEBLO76041 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEBLO76041 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEBLO76041 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEBLO76041 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEBLO76041 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEBLO76041 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEBLO76041 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEBLO76041 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEBLO76041 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEBLO76041 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEBLO76041 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEBLO76041 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEBLO76041 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEBLO76041 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEBLO76041 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEBLO76041 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEBLO76041 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEBLO76041 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEBLO76041 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEBLO76041 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEBLO76041 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEBLO76041 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEBLO76041 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEBLO76041 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEBLO76041 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEBLO76041 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEBLO76041 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEBLO76041 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEBLO76041 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEBLO76041 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEBLO76041 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEBLO76041 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEBLO76041 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEBLO76041 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEBLO76041 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEBLO76041 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEBLO76041 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEBLO76041 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEBLO76041 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEBLO76041 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEBLO76041 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEBLO76041 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEBLO76041 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEBLO76041 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEBLO76041 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEBLO76041 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEBLO76041 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEBLO76041 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEBLO76041 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEBLO76041 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEBLO76041 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEBLO76041 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEBLO76041 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEBLO76041 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEBLO76041 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEBLO76041 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEBLO76041 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEBLO76041 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEBLO76041 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEBLO76041 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEBLO76041 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEBLO76041 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEBLO76041 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEBLO76041 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEBLO76041 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEBLO76041 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEBLO76041 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms