Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP1O75113 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP1O75113 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
N4BP1O75113 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
N4BP1O75113 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
N4BP1O75113 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
N4BP1O75113 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
N4BP1O75113 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms