Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX2O60749 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX2O60749 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX2O60749 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX2O60749 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX2O60749 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX2O60749 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX2O60749 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX2O60749 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX2O60749 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX2O60749 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX2O60749 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX2O60749 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX2O60749 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX2O60749 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX2O60749 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX2O60749 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX2O60749 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX2O60749 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX2O60749 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX2O60749 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX2O60749 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX2O60749 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX2O60749 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX2O60749 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX2O60749 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX2O60749 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX2O60749 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX2O60749 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX2O60749 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX2O60749 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX2O60749 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX2O60749 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX2O60749 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX2O60749 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX2O60749 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX2O60749 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX2O60749 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX2O60749 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX2O60749 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX2O60749 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX2O60749 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX2O60749 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX2O60749 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX2O60749 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX2O60749 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX2O60749 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX2O60749 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX2O60749 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX2O60749 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX2O60749 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX2O60749 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX2O60749 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX2O60749 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX2O60749 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX2O60749 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX2O60749 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX2O60749 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX2O60749 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX2O60749 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX2O60749 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX2O60749 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX2O60749 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX2O60749 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX2O60749 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX2O60749 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX2O60749 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX2O60749 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX2O60749 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX2O60749 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX2O60749 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX2O60749 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX2O60749 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX2O60749 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX2O60749 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX2O60749 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX2O60749 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX2O60749 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX2O60749 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX2O60749 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX2O60749 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX2O60749 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX2O60749 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX2O60749 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX2O60749 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX2O60749 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX2O60749 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX2O60749 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX2O60749 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX2O60749 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX2O60749 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX2O60749 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX2O60749 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX2O60749 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX2O60749 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms