Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.92
SYNJ1O43426 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
SYNJ1O43426 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
SYNJ1O43426 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SYNJ1O43426 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SYNJ1O43426 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.45■■■■■ 4.87
SYNJ1O43426 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SYNJ1O43426 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
SYNJ1O43426 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SYNJ1O43426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
SYNJ1O43426 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SYNJ1O43426 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
SYNJ1O43426 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SYNJ1O43426 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
SYNJ1O43426 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms