Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHDO14521 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHDO14521 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDHDO14521 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHDO14521 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHDO14521 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHDO14521 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHDO14521 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHDO14521 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHDO14521 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDHDO14521 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDHDO14521 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHDO14521 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHDO14521 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHDO14521 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHDO14521 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHDO14521 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHDO14521 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHDO14521 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHDO14521 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHDO14521 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHDO14521 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHDO14521 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHDO14521 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHDO14521 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHDO14521 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHDO14521 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHDO14521 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHDO14521 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDHDO14521 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHDO14521 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHDO14521 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHDO14521 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHDO14521 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHDO14521 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHDO14521 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHDO14521 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHDO14521 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHDO14521 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHDO14521 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHDO14521 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHDO14521 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHDO14521 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHDO14521 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHDO14521 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHDO14521 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDHDO14521 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDHDO14521 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHDO14521 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHDO14521 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHDO14521 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHDO14521 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHDO14521 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHDO14521 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHDO14521 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHDO14521 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHDO14521 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHDO14521 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHDO14521 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHDO14521 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHDO14521 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHDO14521 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHDO14521 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHDO14521 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHDO14521 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHDO14521 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDHDO14521 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHDO14521 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHDO14521 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHDO14521 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHDO14521 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHDO14521 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHDO14521 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHDO14521 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHDO14521 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHDO14521 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHDO14521 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHDO14521 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHDO14521 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHDO14521 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHDO14521 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHDO14521 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHDO14521 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms