Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFBR3LH3BV60 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFBR3LH3BV60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFBR3LH3BV60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR3LH3BV60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR3LH3BV60 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR3LH3BV60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFBR3LH3BV60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGFBR3LH3BV60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms