Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM238C9JI98 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM238C9JI98 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM238C9JI98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM238C9JI98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM238C9JI98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms