Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
STRCP1A6NGW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
STRCP1A6NGW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
STRCP1A6NGW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
STRCP1A6NGW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
STRCP1A6NGW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
STRCP1A6NGW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
STRCP1A6NGW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRCP1A6NGW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCP1A6NGW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms