Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL1

ST20-MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms