Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV23-1A0A0A0MS06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV23-1A0A0A0MS06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV23-1A0A0A0MS06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV23-1A0A0A0MS06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms