Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUSKO15146 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUSKO15146 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUSKO15146 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUSKO15146 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUSKO15146 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUSKO15146 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MUSKO15146 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUSKO15146 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
MUSKO15146 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUSKO15146 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MUSKO15146 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUSKO15146 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms