Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM33P57088 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM33P57088 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms