Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC24CP53992 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC24CP53992 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms