Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD1Q15797 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD1Q15797 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms