Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPK3BL2E5RIL1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms