Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRA6Q9BX79 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms