Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIRE1Q08AE8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms