Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3CQ99985 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms