Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHA9Q7RTU4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHA9Q7RTU4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms