Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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CDH18Q13634 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH18Q13634 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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