Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REG1BP48304 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REG1BP48304 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
REG1BP48304 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
REG1BP48304 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
REG1BP48304 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REG1BP48304 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REG1BP48304 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REG1BP48304 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REG1BP48304 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REG1BP48304 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms