Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF3BA8MYP8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms