Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC6Q9Y210 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC6Q9Y210 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms