Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC30Q5VVM6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC30Q5VVM6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC30Q5VVM6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms