Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRA6Q9BX79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms