Protein–RNA interactions for Protein: P09543

CNP, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPP09543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPP09543 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPP09543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNPP09543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNPP09543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPP09543 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPP09543 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPP09543 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPP09543 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPP09543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPP09543 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPP09543 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPP09543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPP09543 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPP09543 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms