Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC6Q9Y210 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC6Q9Y210 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms