Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.113e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HADHA-204ENST00000492433 752 ntTSL 211.26□□□□□ -0.616e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.723e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.083e-9■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.146e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.246e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.296e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.336e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA4-204ENST00000482299 606 ntTSL 22.49□□□□□ -2.016e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.176e-6■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-204ENST00000489040 523 ntTSL 215.48■□□□□ 0.078e-20■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-209ENST00000528907 861 ntTSL 215.46■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-8■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.58e-7■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 25.15□□□□□ -1.598e-7■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.71e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 529.6■■■□□ 2.331e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.221e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.121e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.111e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 328.07■■■□□ 2.081e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.951e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)26.87■■□□□ 1.891e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)26.48■■□□□ 1.831e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 52.45□□□□□ -2.021e-323■□□□□ 8.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.31e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-204ENST00000465340 2240 ntTSL 212.96□□□□□ -0.331e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-201ENST00000372849 433 ntTSL 58.19□□□□□ -1.11e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.331e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.331e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-208ENST00000491851 547 ntTSL 25.22□□□□□ -1.571e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.871e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 SERF2-215ENST00000475927 692 ntTSL 214.24□□□□□ -0.133e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 519.13■□□□□ 0.653e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 516.31■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 315.67■□□□□ 0.13e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-7■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-207ENST00000481061 914 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-14■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.376e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 216.93■□□□□ 0.36e-33■□□□□ 8.5
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APOBEC3CQ9NRW3 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 511.61□□□□□ -0.556e-33■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.816e-33■□□□□ 8.5
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APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-203ENST00000546368 2008 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.292e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-207ENST00000550238 338 ntTSL 56.49□□□□□ -1.372e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-210ENST00000551291 700 ntTSL 36.46□□□□□ -1.382e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL6-205ENST00000549562 583 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-10■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC14.2□□□□□ -0.144e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM258-205ENST00000540434 553 ntTSL 212.27□□□□□ -0.454e-9■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.764e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COMTD1-202ENST00000460899 1094 ntTSL 223.94■■□□□ 1.424e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COMTD1-203ENST00000469299 871 ntTSL 323.94■■□□□ 1.424e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COMTD1-204ENST00000470947 796 ntTSL 223.94■■□□□ 1.424e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COMTD1-207ENST00000494596 539 ntTSL 221.69■■□□□ 1.064e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)21.42■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 CHCHD2-202ENST00000473095 694 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.127e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.27e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.217e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-208ENST00000476463 427 ntTSL 312.49□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-204ENST00000496156 892 ntTSL 512.31□□□□□ -0.447e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.657e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 ALKBH5-202ENST00000490106 2146 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.674e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.774e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC41-203ENST00000472710 4455 ntTSL 29.99□□□□□ -0.817e-11■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 27.01□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-15■□□□□ 8.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-14■□□□□ 8.5
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