RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473095.1

CHCHD2-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHCHD2, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-202ENST00000473095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.08■■■■□ 3.05
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CHCHD2-202ENST00000473095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.35■■■□□ 2.29
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CHCHD2-202ENST00000473095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.76■■■□□ 2.19
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CHCHD2-202ENST00000473095 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.89■■■□□ 2.06
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CHCHD2-202ENST00000473095 ERCC6Q03468 1493 aa26.69■■□□□ 1.86
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CHCHD2-202ENST00000473095 HMGXB3Q12766 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
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CHCHD2-202ENST00000473095 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
CHCHD2-202ENST00000473095 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.93■■□□□ 1.74
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CHCHD2-202ENST00000473095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.71■■□□□ 1.71
CHCHD2-202ENST00000473095 TRIM41Q8WV44 630 aa25.7■■□□□ 1.7
CHCHD2-202ENST00000473095 CFTRP13569 1480 aa25.68■■□□□ 1.7
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CHCHD2-202ENST00000473095 OSCARQ8IYS5 282 aa25.49■■□□□ 1.67
CHCHD2-202ENST00000473095 PRDM2Q13029 1718 aa25.44■■□□□ 1.66
CHCHD2-202ENST00000473095 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.28■■□□□ 1.64
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CHCHD2-202ENST00000473095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CHCHD2-202ENST00000473095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
CHCHD2-202ENST00000473095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
CHCHD2-202ENST00000473095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
CHCHD2-202ENST00000473095 TOPBP1Q92547 1522 aa25.21■■□□□ 1.63
CHCHD2-202ENST00000473095 ABCC8Q09428 1581 aa25.14■■□□□ 1.62
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CHCHD2-202ENST00000473095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.89■■□□□ 1.58
CHCHD2-202ENST00000473095 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD2-202ENST00000473095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.83■■□□□ 1.56
CHCHD2-202ENST00000473095 FBLN2P98095 1184 aa24.81■■□□□ 1.56
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CHCHD2-202ENST00000473095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
CHCHD2-202ENST00000473095 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
CHCHD2-202ENST00000473095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.7■■□□□ 1.55
CHCHD2-202ENST00000473095 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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CHCHD2-202ENST00000473095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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CHCHD2-202ENST00000473095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CHCHD2-202ENST00000473095 SYNJ2O15056 1496 aa24.58■■□□□ 1.53
CHCHD2-202ENST00000473095 PBRM1Q86U86 1689 aa24.53■■□□□ 1.52
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CHCHD2-202ENST00000473095 ADAMTS12P58397 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
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CHCHD2-202ENST00000473095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.23■■□□□ 1.47
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CHCHD2-202ENST00000473095 SHROOM2Q13796 1616 aa24.21■■□□□ 1.47
CHCHD2-202ENST00000473095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
CHCHD2-202ENST00000473095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CHCHD2-202ENST00000473095 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CHCHD2-202ENST00000473095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.14■■□□□ 1.45
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CHCHD2-202ENST00000473095 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CHCHD2-202ENST00000473095 JPH4Q96JJ6 628 aa23.97■■□□□ 1.43
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