RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-208ENST00000527871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.97■■■■■ 7.35
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RPS2-208ENST00000527871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.36■■■■■ 5.81
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RPS2-208ENST00000527871 SCRIBQ14160 1630 aa49.68■■■■■ 5.54
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RPS2-208ENST00000527871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
RPS2-208ENST00000527871 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.06■■■■■ 5.44
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RPS2-208ENST00000527871 NESP48681 1621 aa46.87■■■■■ 5.09
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RPS2-208ENST00000527871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.66■■■■■ 4.9
RPS2-208ENST00000527871 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.65■■■■■ 4.9
RPS2-208ENST00000527871 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.36■■■■■ 4.85
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RPS2-208ENST00000527871 PRDM2Q13029 1718 aa45.09■■■■■ 4.81
RPS2-208ENST00000527871 TOPBP1Q92547 1522 aa44.83■■■■■ 4.77
RPS2-208ENST00000527871 OSCARQ8IYS5 282 aa44.82■■■■■ 4.77
RPS2-208ENST00000527871 IFT140Q96RY7 1462 aa44.78■■■■■ 4.76
RPS2-208ENST00000527871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
RPS2-208ENST00000527871 ABCC8Q09428 1581 aa44.71■■■■■ 4.75
RPS2-208ENST00000527871 TRIM41Q8WV44 630 aa44.69■■■■■ 4.74
RPS2-208ENST00000527871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.62■■■■■ 4.73
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RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.1■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 ARHGEF11O15085 1522 aa44.04■■■■■ 4.64
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RPS2-208ENST00000527871 WDR97A6NE52 1622 aa43.89■■■■■ 4.62
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RPS2-208ENST00000527871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS2-208ENST00000527871 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS2-208ENST00000527871 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.6■■■■■ 4.57
RPS2-208ENST00000527871 SYNJ2O15056 1496 aa43.6■■■■■ 4.57
RPS2-208ENST00000527871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.51■■■■■ 4.56
RPS2-208ENST00000527871 SYNJ1O43426 1573 aa43.5■■■■■ 4.55
RPS2-208ENST00000527871 PBRM1Q86U86 1689 aa43.48■■■■■ 4.55
RPS2-208ENST00000527871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.48■■■■■ 4.55not detected■■■■□ 25.1
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RPS2-208ENST00000527871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.06■■■■■ 4.48
RPS2-208ENST00000527871 CEP170Q5SW79 1584 aa43.03■■■■■ 4.48
RPS2-208ENST00000527871 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.96■■■■■ 4.47
RPS2-208ENST00000527871 SHROOM2Q13796 1616 aa42.84■■■■■ 4.45
RPS2-208ENST00000527871 JPH4Q96JJ6 628 aa42.7■■■■■ 4.43
RPS2-208ENST00000527871 IGF1RP08069 1367 aa42.68■■■■■ 4.42
RPS2-208ENST00000527871 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
RPS2-208ENST00000527871 KIF27Q86VH2 1401 aa42.58■■■■■ 4.41
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