Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNPPD1Q9BV87 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNPPD1Q9BV87 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms