Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INPP4AQ96PE3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms