Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2C1P98194 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms