Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGM1P36871 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGM1P36871 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PGM1P36871 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PGM1P36871 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PGM1P36871 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGM1P36871 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGM1P36871 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGM1P36871 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PGM1P36871 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms