Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PABPC1P11940 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms