Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITM2AO43736 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITM2AO43736 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms