Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3LQ8TDB6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3LQ8TDB6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DTX3LQ8TDB6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DTX3LQ8TDB6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3LQ8TDB6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3LQ8TDB6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms