Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC9Q6ZRR7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms