Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC93Q567U6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC93Q567U6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms