Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP25-1Q3LHN0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms