RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369125.6

HACE1-202, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HACE1, Length 3,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-202ENST00000369125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.2■■■■□ 3.55
HACE1-202ENST00000369125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.57■■■□□ 2.8
HACE1-202ENST00000369125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
HACE1-202ENST00000369125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
HACE1-202ENST00000369125 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.32■■■□□ 2.6
HACE1-202ENST00000369125 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.31■■■□□ 2.6
HACE1-202ENST00000369125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.31■■■□□ 2.6
HACE1-202ENST00000369125 HRCP23327 699 aa31.25■■■□□ 2.59
HACE1-202ENST00000369125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.17■■■□□ 2.58
HACE1-202ENST00000369125 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.07■■■□□ 2.56
HACE1-202ENST00000369125 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
HACE1-202ENST00000369125 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.59■■■□□ 2.49
HACE1-202ENST00000369125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.43■■■□□ 2.46
HACE1-202ENST00000369125 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HACE1-202ENST00000369125 ABCC9O60706 1549 aa29.84■■■□□ 2.37
HACE1-202ENST00000369125 TRIM41Q8WV44 630 aa29.83■■■□□ 2.37
HACE1-202ENST00000369125 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
HACE1-202ENST00000369125 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.72■■■□□ 2.35
HACE1-202ENST00000369125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
HACE1-202ENST00000369125 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
HACE1-202ENST00000369125 SCRIBQ14160 1630 aa29.67■■■□□ 2.34
HACE1-202ENST00000369125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.51■■■□□ 2.31
HACE1-202ENST00000369125 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HACE1-202ENST00000369125 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.14■■■□□ 2.26
HACE1-202ENST00000369125 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HACE1-202ENST00000369125 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HACE1-202ENST00000369125 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.04■■■□□ 2.24
HACE1-202ENST00000369125 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HACE1-202ENST00000369125 WIZO95785 1651 aa28.91■■■□□ 2.22
HACE1-202ENST00000369125 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
HACE1-202ENST00000369125 NACADO15069 1562 aa28.81■■■□□ 2.2
HACE1-202ENST00000369125 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
HACE1-202ENST00000369125 NEUROD1Q13562 356 aa28.67■■■□□ 2.18
HACE1-202ENST00000369125 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
HACE1-202ENST00000369125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HACE1-202ENST00000369125 ABCC8Q09428 1581 aa28.55■■■□□ 2.16
HACE1-202ENST00000369125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
HACE1-202ENST00000369125 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.52■■■□□ 2.16
HACE1-202ENST00000369125 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HACE1-202ENST00000369125 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.48■■■□□ 2.15
HACE1-202ENST00000369125 CEP162Q5TB80 1403 aa28.48■■■□□ 2.15
HACE1-202ENST00000369125 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HACE1-202ENST00000369125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
HACE1-202ENST00000369125 SOGA1O94964 1423 aa28.4■■■□□ 2.14
HACE1-202ENST00000369125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HACE1-202ENST00000369125 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.31■■■□□ 2.12
HACE1-202ENST00000369125 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.3■■■□□ 2.12
HACE1-202ENST00000369125 SMARCA2P51531 1590 aa28.24■■■□□ 2.11
HACE1-202ENST00000369125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.23■■■□□ 2.11
HACE1-202ENST00000369125 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HACE1-202ENST00000369125 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
HACE1-202ENST00000369125 SMARCA4P51532 1647 aa28.21■■■□□ 2.11
HACE1-202ENST00000369125 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HACE1-202ENST00000369125 EEA1Q15075 1411 aa28.13■■■□□ 2.09
HACE1-202ENST00000369125 GOLGA3Q08378 1498 aa28.08■■■□□ 2.09
HACE1-202ENST00000369125 MIER1Q8N108 512 aa27.97■■■□□ 2.07
HACE1-202ENST00000369125 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HACE1-202ENST00000369125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
HACE1-202ENST00000369125 APLP2Q06481 763 aa27.89■■■□□ 2.05
HACE1-202ENST00000369125 CLIP1P30622 1438 aa27.86■■■□□ 2.05
HACE1-202ENST00000369125 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.84■■■□□ 2.05
HACE1-202ENST00000369125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.83■■■□□ 2.05
HACE1-202ENST00000369125 MYT1Q01538 1121 aa27.77■■■□□ 2.04
HACE1-202ENST00000369125 SYNJ1O43426 1573 aa27.74■■■□□ 2.03
HACE1-202ENST00000369125 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.73■■■□□ 2.03
HACE1-202ENST00000369125 KIF21BO75037 1637 aa27.69■■■□□ 2.02
HACE1-202ENST00000369125 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.65■■■□□ 2.02
HACE1-202ENST00000369125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
HACE1-202ENST00000369125 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.51■■□□□ 1.99
HACE1-202ENST00000369125 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.48■■□□□ 1.99
HACE1-202ENST00000369125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.42■■□□□ 1.98
HACE1-202ENST00000369125 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HACE1-202ENST00000369125 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HACE1-202ENST00000369125 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.34■■□□□ 1.97
HACE1-202ENST00000369125 ITGAEP38570 1179 aa27.28■■□□□ 1.96
HACE1-202ENST00000369125 TOP2BQ02880 1626 aa27.26■■□□□ 1.95
HACE1-202ENST00000369125 ARAP1Q96P48 1450 aa27.26■■□□□ 1.95
HACE1-202ENST00000369125 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HACE1-202ENST00000369125 PRXQ9BXM0 1461 aa27.18■■□□□ 1.94
HACE1-202ENST00000369125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
HACE1-202ENST00000369125 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HACE1-202ENST00000369125 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.08■■□□□ 1.93
HACE1-202ENST00000369125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.08■■□□□ 1.93
HACE1-202ENST00000369125 KIF27Q86VH2 1401 aa27.03■■□□□ 1.92
HACE1-202ENST00000369125 KCNH8Q96L42 1107 aa27.02■■□□□ 1.92
HACE1-202ENST00000369125 CUX1P39880 1505 aa26.97■■□□□ 1.91
HACE1-202ENST00000369125 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.95■■□□□ 1.91
HACE1-202ENST00000369125 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.94■■□□□ 1.9
HACE1-202ENST00000369125 CUX2O14529 1486 aa26.93■■□□□ 1.9
HACE1-202ENST00000369125 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.92■■□□□ 1.9
HACE1-202ENST00000369125 BCANQ96GW7 911 aa26.9■■□□□ 1.9
HACE1-202ENST00000369125 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HACE1-202ENST00000369125 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HACE1-202ENST00000369125 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.82■■□□□ 1.88
HACE1-202ENST00000369125 MAPKBP1O60336 1514 aa26.8■■□□□ 1.88
HACE1-202ENST00000369125 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
HACE1-202ENST00000369125 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.77■■□□□ 1.88
HACE1-202ENST00000369125 FKBP8Q14318 412 aa26.75■■□□□ 1.87
HACE1-202ENST00000369125 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HACE1-202ENST00000369125 P3H3Q8IVL6 736 aa26.72■■□□□ 1.87
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