RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39■■■■□ 3.83
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.35■■■□□ 2.93
PDE4D-204ENST00000358923 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.15■■■□□ 2.9
PDE4D-204ENST00000358923 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
PDE4D-204ENST00000358923 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC9O60706 1549 aa32.22■■■□□ 2.75
PDE4D-204ENST00000358923 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
PDE4D-204ENST00000358923 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.76■■■□□ 2.67
PDE4D-204ENST00000358923 SCRIBQ14160 1630 aa31.49■■■□□ 2.63
PDE4D-204ENST00000358923 NACADO15069 1562 aa31.16■■■□□ 2.58
PDE4D-204ENST00000358923 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.14■■■□□ 2.58
PDE4D-204ENST00000358923 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.91■■■□□ 2.54
PDE4D-204ENST00000358923 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
PDE4D-204ENST00000358923 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.7■■■□□ 2.51
PDE4D-204ENST00000358923 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PDE4D-204ENST00000358923 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.48■■■□□ 2.47
PDE4D-204ENST00000358923 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-204ENST00000358923 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.39■■■□□ 2.45
PDE4D-204ENST00000358923 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.2■■■□□ 2.43
PDE4D-204ENST00000358923 WIZO95785 1651 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-204ENST00000358923 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PDE4D-204ENST00000358923 SMARCA4P51532 1647 aa29.88■■■□□ 2.37
PDE4D-204ENST00000358923 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.67■■■□□ 2.34
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM41Q8WV44 630 aa29.64■■■□□ 2.34
PDE4D-204ENST00000358923 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PDE4D-204ENST00000358923 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.61■■■□□ 2.33
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.54■■■□□ 2.32
PDE4D-204ENST00000358923 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PDE4D-204ENST00000358923 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.41■■■□□ 2.3
PDE4D-204ENST00000358923 SMARCA2P51531 1590 aa29.4■■■□□ 2.3
PDE4D-204ENST00000358923 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC8Q09428 1581 aa29.26■■■□□ 2.27
PDE4D-204ENST00000358923 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.2■■■□□ 2.26
PDE4D-204ENST00000358923 NCAPD3P42695 1498 aa28.93■■■□□ 2.22
PDE4D-204ENST00000358923 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PDE4D-204ENST00000358923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.85■■■□□ 2.21
PDE4D-204ENST00000358923 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.83■■■□□ 2.21
PDE4D-204ENST00000358923 SOGA1O94964 1423 aa28.82■■■□□ 2.2
PDE4D-204ENST00000358923 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.77■■■□□ 2.2
PDE4D-204ENST00000358923 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
PDE4D-204ENST00000358923 HRCP23327 699 aa28.74■■■□□ 2.19
PDE4D-204ENST00000358923 HMGXB3Q12766 1538 aa28.74■■■□□ 2.19
PDE4D-204ENST00000358923 SYNJ1O43426 1573 aa28.66■■■□□ 2.18
PDE4D-204ENST00000358923 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.62■■■□□ 2.17
PDE4D-204ENST00000358923 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PDE4D-204ENST00000358923 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.49■■■□□ 2.15
PDE4D-204ENST00000358923 CFTRP13569 1480 aa28.46■■■□□ 2.15
PDE4D-204ENST00000358923 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PDE4D-204ENST00000358923 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PDE4D-204ENST00000358923 NESP48681 1621 aa28.42■■■□□ 2.14
PDE4D-204ENST00000358923 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.4■■■□□ 2.14
PDE4D-204ENST00000358923 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PDE4D-204ENST00000358923 CUX1P39880 1505 aa28.32■■■□□ 2.12
PDE4D-204ENST00000358923 TOP2BQ02880 1626 aa28.25■■■□□ 2.11
PDE4D-204ENST00000358923 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.14■■■□□ 2.1
PDE4D-204ENST00000358923 CEP162Q5TB80 1403 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-204ENST00000358923 EEA1Q15075 1411 aa28.11■■■□□ 2.09
PDE4D-204ENST00000358923 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.1■■■□□ 2.09
PDE4D-204ENST00000358923 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.09■■■□□ 2.09
PDE4D-204ENST00000358923 MYT1Q01538 1121 aa28.05■■■□□ 2.08
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA3Q08378 1498 aa28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-204ENST00000358923 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PDE4D-204ENST00000358923 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.98■■■□□ 2.07
PDE4D-204ENST00000358923 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.96■■■□□ 2.07
PDE4D-204ENST00000358923 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.95■■■□□ 2.07
PDE4D-204ENST00000358923 CUX2O14529 1486 aa27.95■■■□□ 2.07
PDE4D-204ENST00000358923 PRDM2Q13029 1718 aa27.94■■■□□ 2.06
PDE4D-204ENST00000358923 KIF27Q86VH2 1401 aa27.9■■■□□ 2.06
PDE4D-204ENST00000358923 TOPBP1Q92547 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 KIF21BO75037 1637 aa27.82■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 IGF1RP08069 1367 aa27.79■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 CLIP1P30622 1438 aa27.79■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 PRXQ9BXM0 1461 aa27.77■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.77■■■□□ 2.04
PDE4D-204ENST00000358923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PDE4D-204ENST00000358923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.74■■■□□ 2.03
PDE4D-204ENST00000358923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.73■■■□□ 2.03
PDE4D-204ENST00000358923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.7■■■□□ 2.03
PDE4D-204ENST00000358923 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.65■■■□□ 2.02
PDE4D-204ENST00000358923 P3H3Q8IVL6 736 aa27.62■■■□□ 2.01
PDE4D-204ENST00000358923 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PDE4D-204ENST00000358923 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.53■■■□□ 2
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.51■■□□□ 1.99
PDE4D-204ENST00000358923 ARAP1Q96P48 1450 aa27.47■■□□□ 1.99
PDE4D-204ENST00000358923 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.46■■□□□ 1.99
PDE4D-204ENST00000358923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 APLP2Q06481 763 aa27.44■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 ERCC6Q03468 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.37■■□□□ 1.97
PDE4D-204ENST00000358923 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.37■■□□□ 1.97
PDE4D-204ENST00000358923 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.35■■□□□ 1.97
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1502.6 ms