Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP3Q9Y446 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP3Q9Y446 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKP3Q9Y446 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKP3Q9Y446 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKP3Q9Y446 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP3Q9Y446 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP3Q9Y446 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms