Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BSNQ9UPA5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BSNQ9UPA5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BSNQ9UPA5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BSNQ9UPA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BSNQ9UPA5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BSNQ9UPA5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BSNQ9UPA5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BSNQ9UPA5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms