Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TSKSQ9UJT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TSKSQ9UJT2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSKSQ9UJT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSKSQ9UJT2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TSKSQ9UJT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TSKSQ9UJT2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TSKSQ9UJT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSKSQ9UJT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TSKSQ9UJT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSKSQ9UJT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TSKSQ9UJT2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TSKSQ9UJT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TSKSQ9UJT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TSKSQ9UJT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TSKSQ9UJT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSKSQ9UJT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TSKSQ9UJT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TSKSQ9UJT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TSKSQ9UJT2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TSKSQ9UJT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TSKSQ9UJT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TSKSQ9UJT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TSKSQ9UJT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms