Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP13Q9UII6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP13Q9UII6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP13Q9UII6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUSP13Q9UII6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP13Q9UII6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP13Q9UII6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP13Q9UII6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP13Q9UII6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP13Q9UII6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP13Q9UII6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP13Q9UII6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP13Q9UII6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP13Q9UII6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP13Q9UII6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms